Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms