Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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