Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cox4i1P19783 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms