Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3cP0DOY1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms