Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms