Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifna9P09235 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms