Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxa5P09021 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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