Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrxO55103 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrxO55103 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PrxO55103 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms