Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptpn20O55082 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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