Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copb2O55029 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms