Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsksO54887 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsksO54887 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TsksO54887 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TsksO54887 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TsksO54887 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TsksO54887 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TsksO54887 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms