Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfibp2O35711 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfibp2O35711 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms