Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms