Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cdk16-202ENSMUST00000115364 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Gm21887J3QQ04 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm21887J3QQ04 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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