Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms