Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim22J3QP37 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms