Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm20918J3QN17 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20918J3QN17 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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