Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20834J3QM72 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms