Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20828J3KMI7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms