Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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