Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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