Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms