Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms