Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
1700042G07RikB1AUF7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
1700042G07RikB1AUF7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
1700042G07RikB1AUF7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
1700042G07RikB1AUF7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
1700042G07RikB1AUF7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
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1700042G07RikB1AUF7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
1700042G07RikB1AUF7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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