Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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