Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn6A2AJB9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Lcn6A2AJB9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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