Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV6-7A0A0A0MS04 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms