Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr4Q9Z1L2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr4Q9Z1L2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms