Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnip1Q9WUU8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms