Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nrf1Q9WU00 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms