Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1aQ9JLR9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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