Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclk1Q9JLM8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclk1Q9JLM8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms