Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms