Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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