Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod2Q9JKK7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod2Q9JKK7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms