Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba8Q9JJZ2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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