Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff4Q9ESC8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aff4Q9ESC8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms