Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms