Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms