Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Subh2bvQ9D9Z7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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