Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PudpQ9D5U5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PudpQ9D5U5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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