Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms