Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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