Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms