Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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