Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms