Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6cQ99N08 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms