Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramel1Q99MW3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms