Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrrtQ99MR6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms