Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a9Q99MR3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a9Q99MR3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms